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OpenSPR助力发掘食用果蔬中新冠治疗药物
题目:Targeting novel coronavirus SARS-CoV-2 spike protein with phytoconstituents of Momordica charantia.
苦瓜植物成分对冠状病毒SARS COV-2棘突蛋白的靶向性研究
出处:Journal of Ovarian Research IF=4.234
时间:2021
研究机构:美国莫尔豪斯医学院微生物学、生物化学和免疫学系
研究背景
由SARS-CoV-2病毒引起的新冠肺炎感染目前是全球紧急情况。目前的疫苗接种努力可能会降低感染率,但在选择压力下,菌株变种正在出现。因此,迫切需要找到治疗新冠肺炎、拯救人类生命的药物。在本研究中,我们鉴定了一种食用蔬菜苦瓜(Momordica Charantia)中影响SARS-CoV-2刺突蛋白的植物成分。
研究方法
对苦瓜的成分进行了测试,以鉴定与SARS-CoV-2刺突蛋白结合的化合物。使用MTiOpenScreen网络服务器进行分子对接研究。里宾斯基五规则被用来评估药物与其他靶分子之间的潜在相互作用。用PyMol和Schrodinger软件鉴定亲水和疏水相互作用。OpenSPR平台被用来评估提取物成分(红二醇)和刺突蛋白之间的相互作用。
研究结果
计算机评估表明,苦瓜的植物成分具有低结合能范围,-5.82至-5.97 kcal/mol。一项对接研究揭示了两组在新型冠状病毒的S1和S2域结合的植物成分。OpenSPR实验显示红二醇与新型冠状病毒的S2刺突蛋白有很强的结合亲和力(KD = 1.15 μM)。总的来说,分子对接对接、ADME特性和SPR显示了植物成分和新型冠状病毒刺突蛋白活性位点之间的强相互作用。
结论
苦瓜的植物成分与刺突蛋白S1和S2结合,是治疗新型冠状病毒病毒感染的潜在药物。
参考文献
Singh SK, Singh S, Singh R. Targeting novel coronavirus SARS-CoV-2 spike protein with phytoconstituents of Momordica charantia. J Ovarian Res. 2021 Sep 27;14(1):126.
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